MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017167	GCA	2	6	150692	150697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3502	NC_017167	ATGCA	2	10	150790	150799	40 %	20 %	20 %	20 %	384133931
3503	NC_017167	GAA	2	6	150807	150812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133931
3504	NC_017167	CT	3	6	150893	150898	0 %	50 %	0 %	50 %	384133931
3505	NC_017167	CT	3	6	150928	150933	0 %	50 %	0 %	50 %	384133931
3506	NC_017167	CGA	2	6	150934	150939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3507	NC_017167	AGA	2	6	150943	150948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133931
3508	NC_017167	GCC	2	6	151179	151184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133931
3509	NC_017167	TCA	2	6	151214	151219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133931
3510	NC_017167	AT	3	6	151273	151278	50 %	50 %	0 %	0 %	384133931
3511	NC_017167	A	6	6	151289	151294	100 %	0 %	0 %	0 %	384133931
3512	NC_017167	CGT	2	6	151334	151339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3513	NC_017167	AGTC	2	8	151354	151361	25 %	25 %	25 %	25 %	384133931
3514	NC_017167	GAA	2	6	151374	151379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133931
3515	NC_017167	GGA	2	6	151394	151399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133931
3516	NC_017167	GGT	2	6	151418	151423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133931
3517	NC_017167	GATG	2	8	151547	151554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017167	GCC	2	6	151594	151599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_017167	ATGT	2	8	151633	151640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017167	GAA	3	9	151656	151664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017167	GA	3	6	151694	151699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017167	TCG	2	6	151759	151764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_017167	GA	3	6	151905	151910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017167	ATT	2	6	151989	151994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017167	TG	3	6	152089	152094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017167	GGA	2	6	152118	152123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017167	A	6	6	152188	152193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017167	CTTC	2	8	152215	152222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_017167	AGAT	2	8	152281	152288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017167	TCA	2	6	152323	152328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_017167	GAT	2	6	152371	152376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017167	GATT	2	8	152435	152442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017167	TACA	2	8	152523	152530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_017167	ACC	2	6	152694	152699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_017167	AGG	3	9	152750	152758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017167	ATC	2	6	152823	152828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_017167	ATC	2	6	152846	152851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133932
3538	NC_017167	GAGG	2	8	152920	152927	25 %	0 %	75 %	0 %	384133932
3539	NC_017167	ACA	2	6	153058	153063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133933
3540	NC_017167	CGGA	2	8	153098	153105	25 %	0 %	50 %	25 %	384133933
3541	NC_017167	CGC	2	6	153127	153132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133933
3542	NC_017167	GAG	2	6	153133	153138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133933
3543	NC_017167	GCG	2	6	153258	153263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133933
3544	NC_017167	TTG	2	6	153273	153278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133933
3545	NC_017167	ATGCG	2	10	153369	153378	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_017167	CCG	2	6	153507	153512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_017167	TGA	2	6	153532	153537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017167	CAA	2	6	153593	153598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133934
3549	NC_017167	CGC	2	6	153608	153613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3550	NC_017167	TTC	2	6	153762	153767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133934
3551	NC_017167	GTT	2	6	153806	153811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133934
3552	NC_017167	CTG	2	6	153911	153916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133934
3553	NC_017167	TTC	2	6	154005	154010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133934
3554	NC_017167	CTT	2	6	154013	154018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133934
3555	NC_017167	CTT	2	6	154054	154059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133934
3556	NC_017167	CCG	3	9	154060	154068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3557	NC_017167	CCG	2	6	154121	154126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3558	NC_017167	ATCC	2	8	154183	154190	25 %	25 %	0 %	50 %	384133934
3559	NC_017167	CCG	2	6	154223	154228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3560	NC_017167	CTG	2	6	154290	154295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133934
3561	NC_017167	CTGCG	2	10	154322	154331	0 %	20 %	40 %	40 %	384133934
3562	NC_017167	CCG	2	6	154438	154443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3563	NC_017167	CAC	2	6	154448	154453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133934
3564	NC_017167	TCA	2	6	154549	154554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133934
3565	NC_017167	GC	4	8	154612	154619	0 %	0 %	50 %	50 %	384133934
3566	NC_017167	T	6	6	154688	154693	0 %	100 %	0 %	0 %	384133934
3567	NC_017167	GAT	2	6	154706	154711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133934
3568	NC_017167	CGC	2	6	154719	154724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3569	NC_017167	CTCG	2	8	154774	154781	0 %	25 %	25 %	50 %	384133934
3570	NC_017167	CGA	2	6	154801	154806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133934
3571	NC_017167	CGC	2	6	154850	154855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3572	NC_017167	GTCTCC	2	12	154884	154895	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384133934
3573	NC_017167	GCG	2	6	155018	155023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133934
3574	NC_017167	CTC	2	6	155072	155077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133934
3575	NC_017167	ATGGTG	2	12	155145	155156	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384133934
3576	NC_017167	TCC	2	6	155204	155209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_017167	GGCA	2	8	155234	155241	25 %	0 %	50 %	25 %	384133935
3578	NC_017167	GCT	2	6	155260	155265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133935
3579	NC_017167	AATCG	2	10	155344	155353	40 %	20 %	20 %	20 %	384133935
3580	NC_017167	AGA	2	6	155437	155442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133935
3581	NC_017167	ACG	2	6	155476	155481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133935
3582	NC_017167	CGT	2	6	155622	155627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_017167	GACG	2	8	155634	155641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_017167	TGA	2	6	155698	155703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017167	GTTTC	2	10	155750	155759	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3586	NC_017167	ACTG	2	8	155817	155824	25 %	25 %	25 %	25 %	384133936
3587	NC_017167	ACG	2	6	155875	155880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133936
3588	NC_017167	TGA	2	6	155928	155933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133936
3589	NC_017167	AGC	2	6	155945	155950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133936
3590	NC_017167	AGG	2	6	155951	155956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133936
3591	NC_017167	GTTTG	2	10	155972	155981	0 %	60 %	40 %	0 %	384133936
3592	NC_017167	CCA	2	6	156067	156072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_017167	ATG	2	6	156098	156103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017167	AGGG	2	8	156118	156125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017167	CTG	2	6	156171	156176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_017167	TGCG	2	8	156242	156249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_017167	GGC	2	6	156330	156335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133937
3598	NC_017167	CGT	2	6	156373	156378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133937
3599	NC_017167	GCC	2	6	156392	156397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133937
3600	NC_017167	CGA	2	6	156478	156483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133937
3601	NC_017167	GAG	2	6	156503	156508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017167	CATG	2	8	156516	156523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_017167	ATC	2	6	156525	156530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_017167	GCG	2	6	156545	156550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_017167	CG	3	6	156601	156606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_017167	GGCT	2	8	156720	156727	0 %	25 %	50 %	25 %	384133938
3607	NC_017167	CGC	2	6	156747	156752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133938
3608	NC_017167	GCC	2	6	156801	156806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133939
3609	NC_017167	GGC	2	6	156809	156814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133939
3610	NC_017167	TCC	2	6	156878	156883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133939
3611	NC_017167	TCA	2	6	156885	156890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133939
3612	NC_017167	AGC	2	6	156908	156913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133939
3613	NC_017167	GC	3	6	156924	156929	0 %	0 %	50 %	50 %	384133939
3614	NC_017167	CTC	2	6	156933	156938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133939
3615	NC_017167	GCC	2	6	156962	156967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133939
3616	NC_017167	GCA	2	6	156996	157001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133939
3617	NC_017167	CGA	2	6	157044	157049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133939
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3619	NC_017167	GGC	2	6	157077	157082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133939
3620	NC_017167	AGACG	2	10	157135	157144	40 %	0 %	40 %	20 %	384133939
3621	NC_017167	GCA	2	6	157281	157286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133939
3622	NC_017167	GAT	2	6	157342	157347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133939
3623	NC_017167	GCC	2	6	157409	157414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133939
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3625	NC_017167	CGC	2	6	157623	157628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133939
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